Los Myxinoideos en Chile están representados por las subfamilias Eptatretinae y Myxininae, con un total de 14 especies, cuya identificación resulta compleja debido al bajo nivel de diferenciación morfológica que caracteriza a este grupo taxonómico. A nivel mundial las anguilas babosas constituyen especies de valor comercial, y en Chile se reportan varios intentos para iniciar pesquerías de pequeña escala. El presente estudio tuvo como propósito la descripción de las especies de anguila babosa capturadas en una pesquería incipiente del Estrecho de Magallanes. Los ejemplares fueron colectados durante ocho expediciones de pesca, desde junio de 2009 a octubre de 2010 en Bahía Lomas (53o48`S; 70°46’W) y Agua Fresca (53o23`S; 70°45’W). Las muestras fueron tomadas en dos rangos de profun- didad, 0-70 metros y 71-140 metros. Todos los especímenes fueron pertenecientes a la subfamilia Myxininae. De un total de 3946 anguilas el 99 % (n=3905) pertenecieron a la especie Myxine affinis y el restante 1 % a la especie Notomyxine tridentiger, ambas reportadas para Chile y la Patagonia Argentina. El rango de variación para las variables merísticas, registradas en esta investigación, fue mayor a los reportados en literatura. Esto puede ser explicado por las diferencias en el tamaño de muestra entre el presente estudio y aquellos publicados previamente. Las proporciones corporales y las variables merísticas no fueron especie-específica en Myxine sp, por lo que existe una gran sobre posición de los rangos entre las especies, lo que hace que su uso como diagnóstico no sea aplicable. Esta investigación actualiza la información y extiende los rangos merísticos para ambas especies. El con- ducto esofágico-cutáneo (en N. tridentiger) y el número de dientes fusionados (bicúspide en M. affinis y tricúspide en N. tridentiger), son los caracteres morfológicos que permiten una identificación clara de ambas especies.