En Chile, el currículo nacional de ciencias (biología) es estandarizado y diseñado por el Ministerio de Educación (MINEDUC). Este estudio contribuye a la educación en ciencias analizando el currículo ministerial implementado y su adherencia al Federative International Programme for Anatomical Terminology (FIPAT). El objetivo de este estudio fue evaluar el uso de la Terminología Anatómica Internacional (TAI) en el programa nacional de educación en ciencias, implementado en Chile desde el 2009. Se realizó el análisis de los términos usados en el programa de educación secundaria del MINEDUC (9no a 12mo año). Los términos se identificaron usando el software de análisis de texto Atlas.ti. Luego, se tabularon según: frecuencia, término en latín, traducción al español, uso de términos de acuerdo a FIPAT y tipo de error. Nuestros resultados muestran que el 11,43 % de la terminología usada en el currículo de enseñanza de la biología en secundaria no se adhiere a IAT según FIPAT. El 9no grado de educación en biología muestra el mayor grado de uso de terminología FIPAT, no obstante, también muestra la mayor prevalencia de uso incorrecto de términos. Estos resultados sirven como una importante base para la revisión y estandarización de la terminología utilizada en el campo de la enseñanza de las ciencias. La colaboración entre anatomistas, biólogos y profesores es necesaria para hacer cambios en los currículos y mejorar el uso de IAT en la formación docente y en las clases de biología y ciencias naturales.