El propósito de este estudio fue evaluar los cambios en la tráquea y los bronquios utilizando imágenes de reconstrucción tridimensionales obtenidas de las tomografías computarizadas (TC) iniciales y de seguimiento de pacientes con COVID-19. En nuestro estudio se incluyeron 100 pacientes con COVID-19 mayores de 18 años. Las imágenes de TC se transfirieron al software Mimics y se realizó una reconstrucción tridimensional de la tráquea y los bronquios. Las imágenes de TC iniciales y de seguimiento de los pacientes con COVID-19 se calificaron como ninguna (grado 0), leve (grado 1), moderada (grado 2) y grave (grado 3) según la puntuación total de gravedad pulmonar. Los pacientes se dividieron en grupos de progresión y regresión según el aumento/disminución del grado entre las TC iniciales y de seguimiento. Además, los pacientes se dividieron en grupos de 0 a 2 semanas, de 2 a 4 semanas, de 4 a 12 semanas y de más de 12 semanas según la duración entre la TC inicial y la de seguimiento. Las mediciones medias del área transversal, la circunferencia y el diámetro del bronquio lobar superior derecho, el bronquio intermedio, el bronquio lobar medio y el bronquio lobar inferior izquierdo disminuyeron en las TC de seguimiento del grupo de progresión. No se encontró que esta disminución fuera estadísticamente significativa. En las TC de seguimiento del grupo de regresión, las mediciones del bronquio lobar superior izquierdo y del bronquio lobar inferior izquierdo aumentaron pero no fueron estadísticamente significativas. Al comparar el inicio de la enfermedad y el período de seguimiento, no ocurrieron cambios estadísticamente significativos en la tráquea, el bronquio principal y el bronquio lobar de los pacientes con COVID-19.